U jedinici interne revizije vrši se interna revizija poslovanja Službe, sistematičan pregled i ocjena o upravljanju rizikom, kontrolama i procesu rukovođenja unutar Službe; strateško i godišnje planiranje revizije; testiranje i ispitivanje i ocjena podataka i informacija, izvještavanje o rezultatima i davanje preporuka da bi se poboljšalo poslovanje Službe; vrši kontrolu ispunjavanja zadataka i postizanja definiranih ciljeva Službe, kao i kontrolu ekonomične, efikasne i djelotvorne upotrebe resursa; predlaže podzakonske i druge akte iz svoje nadležnosti o internoj kontroli i reviziji; vrši računovodstveni nadzor i kontrolu ispravnosti materijalno-financijskog poslovanja; vrši kontrolu zakonitosti računovodstvenih transakcija; vrši kontrolu provođenja zakonskih i podzakonskih akta, te obavlja i druge poslove sukladno sa Zakonom o internoj reviziji institucija Bosne i Hercegovine i drugim pozitivnim zakonskim i podzakonskim propisima i internoj reviziji.