Služba za zajedničke poslove institucija Bosne i Hercegovine osnovana je Odlukom Vijeća ministara Bosne i Hercegovine („Službeni glasnik BiH“, br. br. 17/99, 50/10 i 71/11),  radi obavljanja poslova za potrebe institucija Bosne i Hercegovine, koji po svojoj prirodi spadaju u djelokrug zajedničkih poslova. Služba je samostalna u svom radu i ima svojstvo pravnog lica.

Za obavljanje poslova i zadataka iz nadležnosti Službe za zajedničke poslove institucija Bosne i Hercegovine, utvrđene su osnovne i unutrašnje organizacione jedinice. Osnovne organizacione jedinice su:

a)    Ured direktora;

b)    Jedinica interne revizije;

c)    Sektor za investiciono i tekuće održavanje;

d)    Sektor za unutrašnje obezbjeđenje; 

e)    Sektor za servisne usluge;

f)     Sektor za pravne, finansijske poslove i javne nabavke.

Poslovi iz nadležnosti osnovne organizacione jedinice obavljaju se u okviru Odsjeka kao unutrašnje organizacione jedinice.