Služba za zajedničke poslove institucija Bosne i Hercegovine osnovana je Odlukom Vijeća ministara Bosne i Hercegovine („Službeni glasnik BiH“, br. br. 17/99, 50/10 i 71/11), radi obavljanja poslova za potrebe institucija Bosne i Hercegovine, koji po svojoj prirodi spadaju u djelokrug zajedničkih poslova. Služba je samostalna u svom radu i ima svojstvo pravnog lica.
Za obavljanje poslova i zadataka iz nadležnosti Službe za zajedničke poslove institucija Bosne i Hercegovine, utvrđene su osnovne i unutrašnje organizacione jedinice. Osnovne organizacione jedinice su:
Ured direktora;
Jedinica interne revizije;
Sektor za investiciono i tekuće održavanje;
Sektor za unutrašnje obezbjeđenje;
Sektor za servisne usluge;
Sektor za pravne, finansijske poslove i javne nabavke.
Poslovi iz nadležnosti osnovne organizacione jedinice obavljaju se u okviru Odsjeka kao unutrašnje organizacione jedinice.