Služba za zajedničke poslove institucija Bosne i Hercegovine utemeljena je Odlukom Vijeća ministara Bosne i Hercegovine („Službeni glasnik BiH“, br. 17/99, 50/10 i 71/11), radi obavljanja poslova za potrebe institucija Bosne i Hercegovine, koji po svojoj prirodi spadaju u djelokrug zajedničkih poslova. Služba je samostalna u svom radu i ima svojstvo pravnog lica.
Za obavljanje poslova i zadataka iz nadležnosti Službe za zajedničke poslove institucija Bosne i Hercegovine, utvrđene su osnovne i unutarnje organizacijske jedinice. Osnovne organizacijske jedinice su:
Ured direktora;
Jedinica interne revizije;
Sektor za investicijsko i tekuće održavanje;
Sektor za unutarnje osiguranje;
Sektor za servisne usluge;
Sektor za pravne, financijske poslove i javne nabave.
Poslovi iz nadležnosti osnovne organizacijske jedinice obavljaju se u okviru Odjela kao unutarnje organizacijske jedinice.