U okviru Sektora za investiciono i tekuće održavanje osnovane su tri unutrašnje organizacione jedinice i to:
Odsjek za mašinska postrojenja i instalacije;
Odsjek za arhitektonsko-građevinske poslove;
Odsjek za podršku pravosudnim institucijama Bosne i Hercegovine.
Odsjek za mašinska postrojenja i instalacije obavlja poslove tekućeg održavanja objekata, instalacija, uređaja, zagrijavanje i klimatizaciju radnog prostora; obezbjeđuje zagrijavanje i klimatizaciju radnog prostora; vrši stručno tehnički nadzor nad poslovima investicionog i tekućeg održavanja; učestvuje u tehničkim pregledima i konačnim obračunima, vrši pripreme plana izrađuje investicione programe predračuna projekata i zadatke za investiciona i tekuća održavanja, učestvuje u pripremi tendera, te sudjeluje u aktivnostima za stvaranje pretpostavki za kapitalna investiciona ulaganja.
Odsjek za arhitektonsko-građevinske poslove obavlja stručno tehnički nadzor nad izvođenjem poslova investicionog i tekućeg održavanja kompleksa zgrada i zemljišta, održavanje poslovnog prostora i zelenila, vrši poslove koji se odnose na programiranje i planiranje investicionog i tekućeg održavanja objekata i prostora oko objekta, radnih prostorija, te preduzimanje mjera za blagovremeno izvršavanje poslova arhitektonsko-građevinske prirode, projektovanje adaptacije objekata, uređenja interijera i eksterijera institucija BiH, stručno-tehnički nadzor nad vršenjem poslova investicionog i tekućeg održavanja objekata; održavanje kancelarijskog namještaja kao i planiranje, projektovanje i stručno tehnički nadzor radi održavanja radnog prostora; učestvuje u tehničkim pregledima i konačnim obračunima, vrši pripreme plana, izrađuje investicione programe predračuna projekata i zadatke za investiciona i tekuća održavanja, učestvuje u pripremi tendera, te sudjeluje u aktivnostima za stvaranje pretpostavki za kapitalna investiciona ulaganja.
Odsjek za podršku pravosudnim institucijama Bosne i Hercegovine obavlja poslove održavanja objekata i infrastrukture za potrebe pravosudnih institucija Bosne i Hercegovine. U cilju efikasnog i kvalitetnog obavljanja poslova iz nadležnosti Službe, Odsjek za podršku pravosudnim institucijama Bosne i Hercegovine je operativno i fizički izdvojen i smješten u Kompleksu zgrada pravosudnih institucija BiH, na adresi Kraljice Jelene 88 u Sarajevu (u daljem tekstu: Kompleks). U okviru Odsjeka, za potrebe pravosudnih institucija Bosne i Hercegovine, obavljaju se sljedeći poslovi: poslovi održavanja objekata i infrastrukture obuhvataju održavanje objekata i drugih prostora, instalacija i uređaja, rukovođenje, upravljanje i unapređivanje postojećih infrastrukturnih sistema i opreme unutar Kompleksa (sistem grijanja i hlađenja, elektrosistemi, hidrosistemi); izrada investicionih programa, predračuna, projekata i planova za investiciona i tekuća održavanja; obavljanje stručno tehničkog nadzora i učestvovanje u tehničkim pregledima i konačnim obračunima; održavanje poslovnog prostora i zelenih površina; održavanje higijene u Kompleksu i zaštita radne i životne sredine.