Jedinica interne revizije u Službi za zajedničke poslove institucija BiH je nezavisna, samostalna organizaciona jedinica koja, kroz sistematičan i discipliniran pristup, ispituje i ocjenjuje sve procese, aktivnosti i sisteme internih kontrola institucije na svim nivoima upravljačke odgovornosti.

Cilj interne revizije je pružanje usluga koje trebaju pomoći menadžmentu u efikasnom izvršavanju njihovih obaveza, provjeravajući da li je provođenje upravljačkih i kontrolnih mehanizama odgovarajuće, ekonomično i dosljedno u odnosu na zakonske i podzakonske propise, uputstva za rad, interne akte i druge propise. Interna revizija daje nezavisno i objektivno stručno mišljenje i preporuke za unapređenje poslovanja, kako bi se poboljšala uspješnost upravljanja rizicima, kontrolama i procesima rukovođenja. Putem interne revizije upravljačka struktura dobija informacije o funkcioniranju sistema za koji je odgovorna.

Jedinica interne revizije obavlja funkciju interne revizije u skladu sa Standardima interne revizije u institucijama BiH, Zakonom o internoj reviziji u institucijama BiH, Kodeksom profesionalne etike za interne revizore u institucijama BiH, Poveljom interne revizije u institucijama BiH i drugim propisima koji regiliraju oblast interne revizije u institucijama BiH.