Jedinica unutarnje revizije u Službi za zajedničke poslove institucija BiH je neovisna, samostalna organizaciona jedinica koja, kroz sistematičan i discipliniran pristup, ispituje i ocjenjuje sve procese, aktivnosti i sustave unutarnjih kontrola institucije na svim nivoima upravljačke odgovornosti.

Cilj unutarnje revizije je pružanje usluga koje trebaju pomoći menadžmentu u efikasnom izvršavanju njihovih obveza, provjeravajući da li je provođenje upravljačkih i kontrolnih mehanizama odgovarajuće, ekonomično i dosljedno u odnosu na zakonske i podzakonske propise, naputke za rad, unutarnje akte i druge propise. Unutarnja revizija daje neovisno i objektivno stručno mišljenje i preporuke za unapređenje poslovanja, kako bi se poboljšala uspješnost upravljanja rizicima, kontrolama i procesima rukovođenja. Putem unutarnje revizije upravljačka struktura dobija informacije o funkcioniranju sustava za koji je odgovorna.

Jedinica unutarnje revizije obavlja funkciju unutarnje revizije u skladu sa Standardima unutarnje revizije u institucijama BiH, Zakonom o unutarnjoj reviziji u institucijama BiH, Kodeksom profesionalne etike za unutarnje revizore u institucijama BiH, Poveljom unutarnje revizije u institucijama BiH i drugim propisima koji regiliraju oblast unutarnje revizije u institucijama BiH.