Јединица интерне ревизије у Служби за заједничке послове институција БиХ је независна, самостална организациона јединица која, кроз систематичан и дисциплиниран приступ, испитује и оцјењује све процесе, активности и системе интерних контрола институције на свим нивоима управљачке одговорности.

Циљ интерне ревизије је пружање услуга које требају помоћи менаџменту у ефикасном извршавању њихових обавеза, провјеравајући да ли је провођење управљачких и контролних механизама одговарајуће, економично и досљедно у односу на законске и подзаконске прописе, упутства за рад, интерне акте и друге прописе. Интерна ревизија даје независно и објективно стручно мишљење и препоруке за унапређење пословања, како би се побољшала успјешност управљања ризицима, контролама и процесима руковођења. Путем интерне ревизије управљачка структура добија информације о функционирању система за који је одговорна.

Јединица интерне ревизије обавља функцију интерне ревизије у складу са Стандардима интерне ревизије у институцијама БиХ, Законом о интерној ревизији у институцијама БиХ, Кодексом професионалне етике за интерне ревизоре у институцијама БиХ, Повељом интерне ревизије у институцијама БиХ и другим прописима који регилирају област интерне ревизије у институцијама БиХ.